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PyETV: a PyMOL evolutionary trace viewer to analyze functional site predictions in protein complexes

机译:PyETV:PyMOL进化轨迹查看器,用于分析蛋白质复合物中的功能位点预测

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摘要

Summary: PyETV is a PyMOL plugin for viewing, analyzing and manipulating predictions of evolutionarily important residues and sites in protein structures and their complexes. It seamlessly captures the output of the Evolutionary Trace server, namely ranked importance of residues, for multiple chains of a complex. It then yields a high resolution graphical interface showing their distribution and clustering throughout a quaternary structure, including at interfaces. Together with other tools in the popular PyMOL viewer, PyETV thus provides a novel tool to integrate evolutionary forces into the design of experiments targeting the most functionally relevant sites of a protein.
机译:简介:PyETV是一个PyMOL插件,用于查看,分析和操纵蛋白质结构及其复合物中进化上重要的残基和位点的预测。它无缝捕获Evolutionary Trace服务器的输出,即残基的重要性排序,用于复杂系统的多个链。然后,产生一个高分辨率的图形界面,显示它们在整个四元结构(包括界面)中的分布和聚类。因此,PyETV与流行的PyMOL查看器中的其他工具一起,提供了一种新颖的工具,可以将进化力整合到针对蛋白质最功能相关位点的实验设计中。

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